Το περιεχόμενο του μέτρου συνίσταται στην εφαρμογή μέτρων προστασίας του φυσικού περιβάλλοντος της Κ. Μακεδονίας με έμφαση στις ευαίσθητες περιβαλλοντικά περιοχές.  Το φυσικό περιβάλλον της Περιφέρειας δεν έχει τύχει ανάλογης προσοχής: οικοσυστήματα και βιότοποι στις παρόχθιες περιοχές πλήττονται και απειλούνται από ανεξέλεγκτες δραστηριότητες, ενώ η υπέρμετρη τουριστική εκμετάλλευση πλήττει τις παράκτιες περιοχές. Σημαντικότεροι παράγοντες που συντελούν στην υποβάθμιση του φυσικού περιβάλλοντος των παράκτιων και παρόχθιων περιοχών της περιφέρειας, με σημαντικές επιπτώσεις στην ποιότητα ζωής, την υγεία των πολιτών και την περιβαλλοντική ισορροπία είναι:

• υποβάθμιση και καταστροφή οικοσυστημάτων ακτών και λιμνών, λόγω ανάπτυξης ανεξέλεγκτων δραστηριοτήτων (λίμνη Κορώνειας, Δέλτα Αξιού, παράκτιες περιοχές Χαλκιδικής) 
• ρύπανση υδάτων και εδαφών των ακτών και παρόχθιων κοιλοτήτων από αλόγιστη ρίψη γεωργικών, βιομηχανικών και αστικών αποβλήτων σε φυσικούς αποδέκτες (λεκάνη απορροής Αξιού)
• εξαντλητική εκμετάλλευση παράκτιων περιοχών από τουριστικές δραστηριότητες

Το συγκεκριμένο μέτρο επιχειρεί να αντιμετωπίσει τα παραπάνω προβλήματα προωθώντας ειδικές δράσεις:

• αποκατάστασης περιβαλλοντικής ισορροπίας ευαίσθητων περιβαλλοντικά περιοχών με εφαρμογή πολεοδομικών και χωροταξικών κανόνων, αποσαφήνιση χρήσεων γης, θεσμοθέτηση ανώτατων επιτρεπτών ορίων συγκέντρωσης επιβαρυντικών ουσιών για υγρά ρεύματα που αποχετεύονται στους φυσικούς αποδέκτες, εφαρμογή κατάλληλων μηχανισμών εντοπισμού της προέλευσης ρυπογόνων ουσιών και επιβολή κυρώσεων σε περίπτωση υπερβάσεων, σύμφωνα με την αρχή «ο ρυπαίνων πληρώνει», ευαισθητοποίηση κοινού σε θέματα περιβάλλοντος.
• παρεμβάσεων σε περιοχές θιγομένου φυσικού περιβάλλοντος, με έμφαση στις περιοχές NATURA 2000.
• παρεμβάσεων αντιπλημμυρικής προστασίας.

Η προστασία του υδάτινου δυναμικού και των βιότοπων στις ευαίσθητες περιβαλλοντικά περιοχές αποτελούν κύριες προτεραιότητες που αποσκοπούν στην αναβάθμιση τόσο του περιβάλλοντος όσο και της ποιότητας ζωής. Στο πλαίσιο αυτό, προτείνοντα τύποι δράσεων όπως:

• Έργα προστασίας και ανάδειξης ευαίσθητων περιβαλλοντικά περιοχών.
• Παρεμβάσεις αντιπλημμυρικού χαρακτήρα.
• Εκπόνηση μελετών Γενικών πολεοδομικών σχεδίων - ΣΧΟΟΑΠ (Οι μελέτες χωροταξίας (ΓΠΣ ή ΣΧΟΟΑΠ) θα ολοκληρώνονται με την κύρωση τους. Οι πολεοδομικές μελέτες θα ολοκληρώνονται από πράξεις εφαρμογής μέσα σε μια τριετία από την περαίωση της μελέτης και το αργότερο στο οικονομικό κλείσιμο του Προγράμματος. Η μη εφαρμογή των παραπάνω καθιστά τις εν λόγω μελέτες μη επιλέξιμες).